1644年三月十九日，李自成的攻城大軍四面圍定了北京城，行將攻破城門。崇禎帝見大勢已去，決定以君王死社稷。臨死前，他怕城破后自己的皇后、子女被農民軍俘虜糟蹋，先逼迫皇后周玉鳳自殺，然后自己手執長劍，殺死幾個嬪妃，又一劍砍向自己的女兒長平公主。崇禎帝這時說了一句名言：“汝何故生我家？”想來，他在拿劍砍向自己女兒的時候，心里有許多不甘，許多憤恨。

長平公主本能地用手一擋，左臂被崇禎砍斷，倒在血泊中暈死過去。五天后，長平公主醒來，據說她后來出家，成了金庸、梁羽生筆下的獨臂神尼。

但歷史記載，她嫁了人，但因憂傷過度沒幾年就死去。 崇禎自己后來吊死煤山，成為中國歷史上少有的殉國君王之一。崇禎帝共有七子七女，三子早夭，起碼有四個兒子當時在世。其他四女早逝。昭仁公主，被崇禎所殺。長平公主被崇禎砍斷手臂。這樣看來，崇禎死后，他的子女并沒有全死。據歷史記載，太子朱慈烺、三子朱慈炯、四子朱慈炤、五子朱慈煥在李自成從北京敗退后，均不知所終。那么，我們且看看崇禎的子女們下落如何。 他的長子朱慈烺，也就是太子，其實在崇禎死后被農民軍獲得。李自成并沒有殺他，而是封他為宋王。

他的下落有幾個說法，一說后來吳三桂率軍進入北京，準備立他為帝，被多爾袞拒絕。吳三桂于是送他到陜西，后不知所終。另一種說法是朱慈烺流落到民間，餓了許多天去投靠外公。他的外公周奎此時已投靠清朝，乃上報給多爾袞。多爾袞堅決說朱慈烺是假太子，把他殺掉了事。朱慈炯是崇禎的第三子，在北京陷落后一直不知所終。后來歷史上出現過很多號稱朱三太子的人，借著朱三太子的名聲號召反清復明。但實際上，朱三太子此后再沒出現，或者死于亂軍，或者隱姓埋名了。四子朱慈炤和三子朱慈炯差不多，從此人間蒸發了。

倒是五子朱慈煥活了七十多歲。事實上，民間的朱三太子很多時候是指朱慈煥。

朱慈煥逃出北京城，一路乞討流落到一個王姓鄉紳家，那鄉紳見他相貌清奇，了解到他的身份后收留了他。幾年后，鄉紳病故，其他人不愿再擔風險，朱慈煥又流落江湖，后來到江南當了和尚。后來一個胡鄉紳也是見他相貌不俗，極力勸他還俗，把女兒嫁了給他。

朱慈煥隱姓埋名，當起普通老百姓，生了三兒兩女。時間到了康熙年間，康熙帝以圣明著稱，他為了表示自己的風度，曾公開表示要找個明朝皇室后裔去守明帝陵。但后來的事情證明這不過是他的故作姿態。朱慈煥以為時間已經過去了那么久，應該沒問題了，不小心透露了自己的身世。

這期間，先后有不少人冒充朱三太子的名頭起兵反清，康熙帝很是惱火，下令各地方官吏嚴查朱三太子。有一日，一隊清兵忽然殺上門來把他帶走。他被帶走后，除二子其時不在家外，老妻、一子、三女、一媳皆上吊自殺。真正的朱三太子落網，康熙帝并沒有仁慈地放掉他以顯示自己的大度。相反，他下旨：“著凌遲處死，……子俱著立斬。”

他是把朱慈煥當成謀反罪處理了，雖然實際上朱慈煥一生安分守己，但因為他的特殊身份，終沒能逃過此劫。 崇禎帝的子孫至此被捕殺干凈。