水晶頭骨傳說是瑪雅人留給后人的珍貴禮物，里邊潛藏著諸多的秘密。據研究的科學家們發現，當有光束照在這些頭骨上時，隱藏在基底的棱鏡和眼窩里用手工琢磨的透鏡片組合在一起，能產生一系列光學變化，它們所發出的炫目光束，有一種催眠般的魔力，會讓人出現幻覺、幻聽等現象。

曾經研究水晶頭骨長達6年之久的水晶專家富蘭克.多蘭德先生說，他在與水晶頭骨共處時，能聽到一種”非常安靜又引人注意，像是從高音大鐘發出”的聲音，還能從水晶頭骨上看到”山巒、廟宇”等圖像。更有人在撫摸過水晶頭骨后，發現自己身上的疾病居然奇跡般地治愈了，種種神奇的現象實在讓人無法理解。近代光學產生于17世紀，古代瑪雅人不可能會運用。所有集中在水晶頭骨上的謎團都讓人匪夷所思，于是一些崇尚神秘主義的人們干脆把它歸之為是天外來客的杰作。而當他們即將離開之前，又把水晶頭骨作為禮物送給了瑪雅人，之后，瑪雅人就把它一直保存在金字塔里直到被安娜所發現。

對于這種說法，科學家們無從考證，但當科學不能對一些神秘現象做出合理解釋時，這種推測反而更容易讓人接受，或許它真是外星人的杰作呢。

而水晶頭骨中最神秘的米歇爾黑吉斯水晶頭骨更是聚集了種種神秘現象和不解之謎。但實際上，這顆頭骨并不是第一個也不是唯一一個被發現的頭骨。到目前為止，世界上總共發現了大約十幾顆水晶頭骨，其中有3顆保存在博物館或研究機構內，其余都被私人收藏。而且，這十幾顆水晶頭骨也不全是瑪雅人的遺物。但是在所有的這些頭骨中，米歇爾.黑吉斯頭骨無疑是純度最高、最完美也最神奇的一個。

也許正因為這顆頭骨太完美了，以至于遭到了人類的妒嫉，讓人懷疑起它的真實來歷。尤其是這個水晶頭骨的具體出土時間，安娜本人竟有不同的說法。

她在1962年接受采訪時說，水晶頭骨是在30年代末，由她的父親在一次挖掘瑪雅遺址的時候發現的;1968年，她給一個研究水晶頭骨的專家寫信時又說頭骨是在1926年發現的;1982年，她回答學者尼克爾的詢問時，又變成是1924年;在1995年出版的《水晶頭骨之謎》里面，又說水晶頭骨是在安娜17歲生日那一天發現的。這些，都不得不讓人懷疑米歇爾.黑吉斯水晶頭骨的真實來歷。

調查者還發現，在印第安人中，只有古阿茲特克人有雕刻頭骨的習慣，而古代瑪雅人并沒有這樣的習慣，這就更使得籠罩在這顆頭骨上的神秘光環顯得越來越虛假了……

科學家們認為，水晶是一種神奇的東西，很容易令人著迷，另外，頭骨也很容易讓人聯想到死神和死亡，用水晶來雕刻頭骨，這種催眠的作用一下子就加倍了，所以容易受到暗示的人就會被它催眠，產生幻聽、幻覺。一起震驚考古界的事件發生了：英國大英博物館的墨西哥古阿茲特克人的水晶頭骨被科學家正式鑒定為是贗品，考古界為之嘩然。

與此同時，人們對米歇爾.黑吉斯頭骨也提出全面質疑。這兩顆頭骨雖然來源不同，但總體形狀卻非常相似，而且都是以一具女性頭骨為模型，不同的是，大英博物館的頭骨是一整塊水晶，而米歇爾.黑吉斯頭骨的下頜則是獨立的，可以拆下，做工更為精致，但是兩顆頭骨的驚人相似，讓人很難相信它們是獨立制作的。

英國大英博物館所珍藏的那塊水晶頭骨，最早據稱是在墨西哥古阿茲特克人遺址上被發現的。而科學家發現這個水晶頭骨是用輪式工具打磨并且切割的，而這種技術在當時的美洲大陸根本就不存在。毫無疑問，現在人們更有理由懷疑米歇爾.黑吉斯水晶頭骨的真實性了。

有一部分科學家傾向于它不是瑪雅人的遺物，而是19世紀現代人的產物。但是，這種百分之百純凈透明的水晶，就算它不是一件文物，其價值也無法估量。誰會用它來制作一件冒充文物呢？如今，安娜已經拒絕對水晶頭骨再做任何科學鑒定，因此，它究竟是不是現代人制作的贗品，科學家們還不能論斷。

這些水晶頭骨是現代人給我們開的一個玩笑嗎？我們不得而知，至于是否集齊所有頭骨會產生奇異現象，我們也不得而知，因為目前還沒有全部找到呢。