如今，西醫成為人們日常行醫看病的主要方式，早已取代了往日中醫的顯赫地位。然而，在它初傳之時，并未引起人們太多的重視，人們更多的是對它的好奇。

西方醫學是以古希臘、古羅馬醫學為基礎，并隨著自然科學的進步逐漸形成和發展起來的。西醫作為一門科學，16世紀以后大規模進入中國。

然而，西醫最初走進中國時，不是具體醫道的傳播，而是以介紹西醫的基礎生理學知識為主。明末關于這方面的知識，首先零散地出現在一些傳教士的著作中。入華的耶穌會士，為吸引更多的中國人入教，對16世紀西方新興醫學特別是比利時維薩留斯《人體的構造》中的人體生理知識給予了一定介紹。1569年，主教加內羅在澳門設立醫院，可謂近代西醫傳入中國之始。利瑪竇的《西國記法》則是西方傳入中國的第一部心理學著作。湯若望的《主體群征》(1629年刻印)對人體解剖學進行了介紹。更為系統全面介紹人體生理的著作是《人身圖說》和《泰西人身說概》。

《人身圖說》主要論述臟腑、脈絡、溺液、女人自貢、胚胎等內容，共28篇，并附有五臟軀殼圖形21幅。《泰西人身說概》上卷敘述人體骨、肉、筋、皮、脈絡等15部，下卷闡述總覺司、目、耳、鼻、舌、四體覺司、行動、語言等8部。此外，西方的醫療制度、醫院設施、藥物藥房等內容也在一些著作中提到。但明末西醫的傳入只是一個開始，難以被接受。到了清代，西醫才開始被應用。

1690年(康熙二十九年)前后，康熙因身體欠佳對西醫產生興趣。他對傳教士白晉等人講述的西醫中的病因知識及相關的生理學，特別是17世紀法國解剖學家韋爾納的著作頗感興趣，指令他的最好的一個畫家，專畫人體解剖圖像，并將中醫中的銅人模型與之進行對比，發現銅人模型也有靜脈但無動脈和血管。1698年，法國傳教士巴多明參考最先進的西醫理論，用了近五年的時間將白晉等人的講稿整理譯成滿文，編譯成《按血液循環理論及戴尼新發現而編成的人體解剖學》。康熙帝對此很關注，但為維護封建禮教未令刊行。此書在丹麥哥本哈根皇家圖書館被發現，1928年以《解剖學詮釋》出版。

西醫入華后，產生了兩種截然不同的態度。有些學者對西醫產生了濃厚興趣，常與傳教士研討西醫，行醫也兼采西醫治病。王宏翰便是第一位接受西醫的醫家。1688年王宏翰四卷本的《醫學原始》集中反映了他所受西醫的影響。乾隆時的王清任，也是篤信西醫的學者，平素常以未見人體臟腑為憾。1797年，灤州瘟疫流行，小孩死者多且多無棺材。王清任趁機察看小孩死者臟腑達三十多人，才弄清中國古代醫書所繪臟腑與實不符，后著成《醫林改錯》記述腦髓說，頗多卓見。

排斥西醫者也大有人在。經學家俞正燮出于反宗教情緒，誣蔑中外的臟腑不同，抨擊西醫。姚瑩在《康猷紀行》中講述天主教源流，也引粵中奏章說習教的人，借此誘淫婦女，取人死后目睛。

西醫，由于它在人體結構和生理功能認識及醫療體制上較中醫有所長，引起了人們出于獵奇心理的關注，但并未對中醫引起沖擊和震蕩。直到1908年，光緒皇帝和慈禧太后先后在數日內亡故，太醫院因而獲咎。太醫院作為舊時代傳統中醫的象征從此消失。在清末至辛亥革命建立新政權時期，西醫被納入國家行政部門。這表明，西醫已正式進入中國，占據中國醫壇的首要地位。