永歷十五年(1661年)，鄭成功原部將黃梧降清后，向清廷密陳“滅賊五策”，其中第三、四策直接針對(duì)鄭芝龍和鄭家祖墳：“三，其父鄭芝龍羈縻在京，成功賂商賈，南北興販，時(shí)通消息。宜速究此輩，嚴(yán)加懲治，貨物入官，則交通可絕矣。四，成功墳?zāi)宫F(xiàn)在各處，叛臣賊子誅及九族，況其祖乎？悉一概遷毀，暴露殄滅，俾命其脈斷，則種類不待誅而自滅也。”這是十分陰險(xiǎn)毒辣的計(jì)謀。

自鄭成功海上起兵抗清以來(lái)，清廷就一再利用鄭芝龍逼迫鄭成功就撫，鄭成功不為所動(dòng)，拒不投降，清廷遂加緊迫害鄭芝龍，1655年，清廷削鄭芝龍爵;1657年，鄭芝龍被流放寧古塔。鄭成功東征臺(tái)灣后，清廷見(jiàn)招降鄭成功的希望更加渺茫，遂采納黃梧的所謂“滅賊五策”，將鄭芝龍一家十一口殺害，并派清兵到南安挖掘鄭成功的祖墳，以在心理和氣勢(shì)上打擊鄭成功。

當(dāng)鄭成功聽(tīng)到父親被殺，“頓足擗踴，望北而哭曰：‘若聽(tīng)兒言，何至殺身。’”鄭芝龍當(dāng)初的投降戰(zhàn)略，不僅招致自己的殺身之禍，而且禍延子孫，成為重創(chuàng)鄭成功脆弱心理的重磅炸彈;當(dāng)鄭成功聽(tīng)聞祖墳被毀的消息時(shí)，更是痛哭流涕，“向西切齒而罵曰：‘生者有怨，死者何仇！敢如此結(jié)不共戴，倘一日治兵而西，吾不寸磔汝尸，枉作人間大丈夫！’”可見(jiàn)，這些慘無(wú)人道的卑劣手段對(duì)鄭成功傷害之大、刺激之深！

而在內(nèi)憂外患中，在愁云慘霧里，成為壓垮鄭成功這匹駱駝最后一根稻草的，則是發(fā)生在廈門(mén)鄭府的一宗家丑。

鄭成功征臺(tái)時(shí)，留下長(zhǎng)子鄭經(jīng)監(jiān)守廈門(mén)。鄭經(jīng)娶隆武時(shí)期兵部尚書(shū)唐顯悅的孫女為妻，唐氏端莊賢淑，但與鄭經(jīng)感情不睦。鄭經(jīng)與五弟的乳母陳氏私通，生一男孩，并以侍妾生子上報(bào)鄭成功。鄭成功年未四十，新得男孫，十分高興，大加賞賜。唐顯悅為替孫女出氣，遂寫(xiě)了一封信給鄭成功，備述詳細(xì)，并在信中責(zé)罵道：“三父六母，乳母亦居其一。令郎狎而生子，不聞飭責(zé)，反而簣賞。此治家不正，安治國(guó)乎？”鄭成功一生深受儒家思想影響，持家治國(guó)，向以嚴(yán)厲著稱，看了這封信，頓時(shí)怒不可遏，立即派人去殺鄭經(jīng)、陳氏母子，以及鄭經(jīng)母董氏，懲罰其治家不嚴(yán)。

鄭泰、洪旭等人接令后大為震驚。商量之后，只殺陳氏母子復(fù)命，并為鄭經(jīng)和董氏夫人求情。鄭成功不允，再次命令要?dú)⑧嵔?jīng)和董氏。其時(shí)，金廈一帶傳言紛紛，鄭泰等人則帶頭抗命，眾將形成公然抗命的局面。臺(tái)灣正缺糧、缺餉，廈門(mén)“不發(fā)一船至臺(tái)灣”，鄭成功萬(wàn)分焦急。

遭此家變，父子故將呈分崩離析之勢(shì)。鄭成功憂心如焚又萬(wàn)分痛心：“我欲成大事，乃不能治家，遑問(wèn)天下。”在無(wú)可奈何的困境中，憤怒與憂慮將他擊倒，風(fēng)寒和郁結(jié)更使他一病千古。

一代名將走到了生命的盡頭，而一個(gè)強(qiáng)盛的海權(quán)時(shí)代也因?yàn)猷嵤虾Ｉ碳瘓F(tuán)的衰落而消失在滾滾的波濤之中。

由此可見(jiàn)，鄭成功遽而離世，其子鄭經(jīng)難辭其咎。而且其后的變亂也因此而起。成功故將黃昭、蕭拱宸以鄭經(jīng)“不堪為人上”，擁立鄭成功幼弟鄭襲“繼統(tǒng)”，聯(lián)絡(luò)成功族兄鄭泰為奧援，約定“金廈他自為之”，使臺(tái)灣呈現(xiàn)“擁襲拒經(jīng)”的態(tài)勢(shì)。

鄭經(jīng)留守廈門(mén)，先遭追殺，又遇父喪。當(dāng)此亂云飛渡之際，因得到兵官洪旭、前提督黃廷、五軍戎政王秀奇等人的擁護(hù)，化危為機(jī)，在廈門(mén)嗣繼藩位，授陳永華為“諮議參軍”，謀劃和實(shí)施掌握金廈政局和平息臺(tái)灣危機(jī)。