元朝的敗亡，其主要原因在于其政治黑暗，民族歧視和政治壓迫政策。統治集團內部爭權奪利政局不穩，皇帝大多不理國政，貪圖享受，腐化至極，經臣鉤心斗角，欺上瞞下，朝廷橫征暴斂，經濟越來越衰，激起廣大人民的反抗。各地農民起義，指向元朝。元朝在歷史潮流面前衰亡。

元朝中期頻繁更換皇帝，僅在1307年(大德十一年)至1333年(元統元年)就更換36個皇帝，在位都很短。全由權臣擺弄下詔或頒布詔令。皇帝成為傀儡，不能決策大事。宮廷紛爭連續不斷，爾虞我詐時時出現。再加上經濟落后，廣大人民處于水深火熱之中，中原地區農民尤其悲慘，饑寒交迫，其嚴重程度已達到再也不能忍受的地步。這樣，人民群眾被迫起來反抗，農民舉行起義，提出“驅逐胡虜，恢復中華，立綱陳紀，救濟斯民”的口號，將矛頭指向元朝。

元朝末期的妥歡帖睦爾在位較長。他從1333年(元統元年)六月至1368年(至正二十八年)七月，共35年的時間，是處在農民起義軍的進攻與元朝軍的抗擊時期。可是，在這樣長時間內元軍之敗，其原因不在將帥無能，士兵不勇，而是元朝政權不修政治，不興經濟，無休止的內部爭權奪利，互相殘殺的結果。尤其順帝是個昏君，朝令夕改，出爾反爾，不得從臣之心。所以，宋王及地方勢力首領，在危急時刻拒絕帝詔，不遣兵參戰，造成四分五裂。無論哪個朝代，其被滅亡之幫，皆不外乎朝廷之腐敗，群臣之相互爭權奪利，互相殘殺和君主之昏庸。這也可說是一種國家滅亡的基本規律。

元朝在戰略上麻木不仁，未進行有組織的反攻。當中原地區各地的農民組織起來，舉行起義，大反元朝時，朝廷仍在內部紛爭，爾虞我詐，沉醉于酒色，耳不聞外界之動亂，更沒有料到起義軍會進而埋沒元朝。甚至在各地農民起義軍稱帝、稱王時，朝廷也無計議對策，不能采取戰略措施，只是零星下詔，以地方軍相抗擊或鎮壓罷了。在戰役上，各地元軍沒有有計劃、有組織地實施聯合作戰，而是各自為戰，如察罕帖木兒、李思齊各據一方，互不聯合。后來竟為互相爭地盤而開戰；禿堅帖木兒軍，不但不聯合擴廓帖木兒作戰，反而進入京城兩次；漠北之陽翟王阿魯渾帖木兒不受君命，還有奪順帝之位的野心，這證明元軍勢力之衰弱，國敗朝亡，已為時不遠了。元朝未能及時抓住農民起義軍低潮之際，組織反攻；在戰略上推動了時機。

1354年(至正十四年月日)九月，脫脫率領號稱百萬軍，十一月圍困高郵城，張士誠十分危急，將要投降，順帝突然下詔，免其百萬大軍之統帥權，使張士誠得以轉危為安。這是元廷的大錯誤，其后果是使得百萬大軍潰散了，元軍受到嚴重的挫傷，而各地農民軍從低潮轉入高潮。

元軍推動戰略反攻的又一個時機是，1363年(至正二十三年)春，大宋朝林兒，間(離間)福通的失敗和起義軍互相攻擊，如至正二十三春，張士誠殺劉福通，大宋紅巾軍亡；秋季，朱元璋殺陳友諒，天完及漢國一系列的紅巾軍敗亡。恰在此時，元軍未能組織對朱元璋部反擊，元朝反而出現軍閥混戰、宗王之爭。結果，元朝給了朱元璋北上滅亡的好機會和有利條件。

總的說來元朝的快速滅亡，其原因就是：一，拒絕漢文化；二，拒絕民族融合；三，貪污腐敗。