馬仲英起事的原因據說是因為馮玉祥國民軍趙席聘部在河州征糧、索款，雷厲風行，河州發生回族間的教派之爭，趙將當事的頭目抓來殺掉，因而激起了眾憤，教民們起來向河州進攻。曾任馬麒部下的營長馬仲英在馬麒的慫恿下，趕到河州，把起事的教民組織起來，勢力逐漸擴大，向河州猛攻，戰事就一躍而無法控制了。馬仲英之父馬寶亦在此時被國民軍處死。馬仲英率眾向河州進攻，趙席聘外號“趙大肚子”，“在國民軍中從未打過一個勝仗”，是有名的腐朽無能的庸將，招架不住馬仲英手下的亡命之徒，退守在河州城內，電劉郁芬告急求援。當時國民軍在蘭州的部隊只有戴靖宇新編的一個師和李松昆、劉兆祥的兩個旅。劉命戴靖宇的一師從寧定川向河州增援。戴部在南陽坡與馬仲英相遇，雙方傷亡都很重，戴靖宇肋部中彈，舁回蘭州，因而這路的攻勢受到頓挫。與此同時，李松昆、劉兆祥的兩個旅也奉劉的命令從唐汪川向河州增援。李、劉兩旅到達河州時，馬仲英已經向河州的西鄉退去。

時值天下大亂，成者為王，敗者為寇，馬仲英起事也算事出有因。然而，無論國民軍征糧有多重、索款有多急，都不能成為馬仲英屠殺無辜漢族人民的理由。馬仲英所至，屠殺漢人，極為殘酷。“陷湟源殺漢人三千余人，陷永昌殺漢人二千三百余人，陷民勤殺漢人四千六百余人，馬廷勷陷涼州，冀魯豫客籍漢人，幾無幸免?！?政協文史研究會 文史資料選輯第七十五輯)。無辜百姓的鮮血染紅了馬仲英的馬刀。濃烈的血腥味在今天似乎已經淡漠，紅柯先生的煌煌大作《西去的騎手》成了今日的暢銷書，然而，書中 ‘我們起兵造反打國民軍，漢人你一個逗不成，殺官劫兵搶富漢。[逗：動，招惹。]與你窮人莫相干，我們要當英雄漢，窮人貴賤不要犯，阿一個殺下漢民的老百姓，一個人哈十個人抵命?！耆菑仡^徹尾的謊言！在這場變亂中，大量的漢、回無辜百姓死于非命，亡魂的怨氣充塞于天地之間。用謊言堆砌成的神話，文辭再優美，語調再動聽，也終歸有煙消云散的一天。陳年的傷口需要精心呵護、調養才能平復，它經不起反復的翻動，更何況再涂上毒藥呢？

被這位紅先生吹得神乎其神的馬仲英其實只是包圍了草包趙席聘，打敗了戴靖宇的新兵而已。北伐結束后，中原息兵，一九二八年秋，孫連仲部隊奉命西來，克復涼州，進軍西寧。劉郁芬以孫連仲部隊進抵涼州，已無后顧之憂，遂重新部署河州部隊，向馬仲英反攻，馬仲英立即露出了銀樣镴槍頭的原形。北原一役，馬匪傷亡頗重，退出河州，南竄洮岷，復結合當地回民，聲勢又震，分股北犯，進擾渭源。馮安邦旅，阻敵于渭源西南，馬遂東竄圍攻隴西，吉鴻昌率十一師所轄李松昆、劉兆祥兩旅馳援，叛軍解圍南走，陷武山，據伏羌(甘谷)，平叛大軍追至伏羌，敵已北竄秦安。翌日，吉鴻昌于赴秦安途中，折往天水，偃旗息鼓，黃昏入城。入城后部隊作以下部署：四門以內地區，各配置步兵一團，由團再酌派便衣部隊潛伏城關，滬造山炮曳上鼓樓，炮口分向城門方向放列，以留守處傷愈官兵百余，配合縣隊，由留守參謀任伴蘭率領，上城守衛，鳴鑼擊鼓，表示空虛，待敵逼近城垣，炮兵接到發射命令，連續放炮，同時發射，炮擊停止，潛伏城關便衣部隊，即向當面之敵出擊，各團迅速增援，敵如退卻，分途窮追，當晚部署既定，以待明日殲敵。翌晨見城外西北山頭，遍豎旗幟，敵兵麋集，何止萬千，紛紛下山，逐步向城垣包圍，大喊大叫：“開城不殺不燒，如果打進城去，雞犬不留?！睍r值正午，吉鴻昌見敵已逼近城垣，，即下令炮兵發炮，炮兵停止，城關部隊立即出擊，城內部隊繼之于后，叛軍驚如空天霹靂，猝不及防，掉頭便走，自相踐踏。十一師歩機槍齊發，叛軍傷亡枕籍、潰散遍野，一部竄至西南山口，企圖繞山逃走。而炮火已將路口封鎖，追兵繼之，叛軍進退失據，傷亡尤多。經此戰役，殘匪又逃回岷縣，十一師繼續追擊，馬仲英率殘部向西寧退去。

由天水經岷縣至洮州，沿途數百里，滿目瘡痍，村民稀少，雞犬盡絕，更無牛羊之跡。當時隴南雖未經嚴重兵火，而人民苦于征役，加以股匪蹂躪，民不堪命。據吉鴻昌的參謀長傅二虞回憶：“我在成縣行軍途中，遇一婦人，另有一女子隨其后，年約十四、五歲，上披破襖，下體赤露，我叫勤務兵給這婦人五元錢，婦人接錢在手，返身追來，連喊叫我站住，她說‘大人你貴姓?。俊艺f：‘你別問我姓名，趕快給你姑娘做條褲子吧?！比俗x至此，孰不鼻酸？這就是紅柯先生“有關英雄和血性的史詩式長篇”背后的情況。

一九二九年，農歷二月上旬，劉郁芬急電吉鴻昌：“馬仲英匪部經永昌攻陷鎮番(民勤)，殺掠極慘，該師迅即進剿?！辨偡莾?，商店住戶，大街小巷，尸體縱橫，其中尤以婦孺為多，此皆當馬仲英入城時，未及逃出，慘遭屠殺者。吉鴻昌召集難民回城，責令縣政府救濟，派軍隊掩埋尸體，清除街道。即使在此時，吉鴻昌也注意整頓軍紀，軍中有擅取回民衣服者，吉鴻昌即將一個連長、兩個排長當場槍決，以為擅取民物者戒。

馬仲英于農歷三月上旬攻陷寧夏省城，軍政機關職員，多未逃出，相率隱蔽在商店或百姓家，馬仲英日事搜查，一經逮捕，悉予殺害。當吉鴻昌從馬仲英手里克復寧夏后，一個警察槍殺了一個沒有逃跑的無辜回民，吉鴻昌一知道這個情況，立即把這個警察予以正法，并發出告示，保護和安撫回民。吉鴻昌、馬仲英相比不啻霄壤，紅柯將二人并列，實在是侮辱了九泉之下吉將軍的英靈。

后來馬仲英在新疆也多次屠城。筆者去開都河流域考察水土流失情況時，看到了焉耆、和靜等縣的縣志。在現在已經成為回族自治縣的焉耆縣縣志中，清楚地記載了馬部屠城的經過，行政長牛時全家被殺，農歷新年暴徒們以大刀、木棒血洗了焉耆古城，只有極少數漢人由阿訇陜文清保護了下來。在現在很多所謂的紀實作品中，馬仲英往往以英雄形象出現，大量篇幅夸張其悍不畏死的虛勇，對其暴行卻只字不提。難怪不明真相的讀者讀了這樣的作品，會把馬仲英部當作秋毫無犯的仁義之師了。