1644年10月，年僅七歲的順治帝在北京南郊告祭天地，即皇帝位，向天下宣布“茲定鼎燕京，以綏中國(guó)”，標(biāo)志著清朝正式入主中原。此后清朝開始進(jìn)行長(zhǎng)期的統(tǒng)一戰(zhàn)爭(zhēng)，但在清朝前期，這個(gè)王朝最大的敵人既不是南明，也不是李自成、張獻(xiàn)忠的起義軍，更不是吳三桂，那么這個(gè)王朝最大的威脅到底是誰呢？

其實(shí)清朝前期最大的威脅并非南方的反清復(fù)明勢(shì)力，而是來自西邊漠西蒙古準(zhǔn)噶爾部，這一點(diǎn)從時(shí)間上就能看出來！清朝對(duì)付南明用了39年(1644年至1683年收復(fù)臺(tái)灣)，對(duì)付李自成的農(nóng)民軍用了20年，對(duì)付張獻(xiàn)忠的農(nóng)民軍用了18年，對(duì)付吳三桂用了8年，而為了對(duì)付準(zhǔn)噶爾部，竟然用了將近百年，歷經(jīng)康熙，雍正，知道乾隆年間才將其徹底平定！準(zhǔn)噶爾部講究是怎樣的部落呢，他又為何能與清朝相持百年之久？

明末清初的時(shí)候，蒙古分為三部，漠南蒙古、漠北蒙古、漠西蒙古三部。漠南蒙古大致相當(dāng)于今天的內(nèi)蒙古，漠北蒙古相當(dāng)于今蒙古國(guó)，而漠西蒙古呢，它大概占據(jù)今天的新疆、西藏以及中亞地區(qū)。漠西蒙古分為四大部，準(zhǔn)噶爾、和碩特、土爾扈特、杜爾伯特，其中準(zhǔn)噶爾的勢(shì)力頗為強(qiáng)大。

明末清初之際，當(dāng)清朝在東北崛起的時(shí)候，準(zhǔn)噶爾部在西北同樣強(qiáng)大起來，他們欺凌土爾扈特部，把他們趕到了伏爾加河流域，接著又侵占杜爾伯特的領(lǐng)地，通過不斷的對(duì)外擴(kuò)張，準(zhǔn)噶爾已經(jīng)占據(jù)北接額爾齊斯河、鄂畢河、葉尼塞河上游，南至西藏阿里地區(qū)，西包巴爾喀什湖，東至蒙古薩彥嶺及色愣格河流域，擁有將近四百余萬平方公里的土地。

但此時(shí)的準(zhǔn)噶爾頗為低調(diào)，對(duì)清朝依然采取納貢稱臣的舉措。但隨著其首領(lǐng)的病死，其內(nèi)部發(fā)生奪位之戰(zhàn)，就在此時(shí)，已經(jīng)出家的噶爾丹成為準(zhǔn)噶爾部新的首領(lǐng)。噶爾丹繼承汗位后，雄心勃勃，對(duì)漠北蒙古喀爾喀部進(jìn)行戰(zhàn)爭(zhēng)，意圖統(tǒng)一蒙古諸部，重新建立一個(gè)強(qiáng)大的蒙古帝國(guó)，甚至想與清朝一決高下，從而入主中原！

康熙帝此時(shí)已經(jīng)看出噶爾丹的威脅，為此他先后三次親征，大敗噶爾丹。東征受挫的噶爾丹的四面楚歌，他的侄子策妄阿拉布坦也在背后“捅刀”，噶爾丹被迫服毒自殺，他的妻子女兒向清朝投降。在影視劇中噶爾丹娶了清朝的公主，必須說明這是虛構(gòu)的。

噶爾丹雖死，但準(zhǔn)噶爾的勢(shì)力并未減弱，策妄阿拉布坦與他的兒子噶爾丹策零繼續(xù)統(tǒng)治準(zhǔn)噶爾部。準(zhǔn)噶爾部開始進(jìn)犯西藏、青海等地，與清朝的戰(zhàn)爭(zhēng)又起，康熙帝甚至派出自己的第十四子為大將軍王，率軍平叛，此后雍正帝又派親信年羹堯坐鎮(zhèn)西北。至1734年，清朝與準(zhǔn)噶爾部議和，雙方甚至劃定可邊界。

但隨著噶爾丹策零的死，準(zhǔn)噶爾又爆發(fā)了奪位之爭(zhēng)，嚴(yán)重削弱了自身實(shí)力。乾隆帝此后再次用兵，并派出大將兆惠為帥。至1757年，兆惠率軍占領(lǐng)烏魯木齊，此后他又平定策妄阿拉布坦的外孫阿睦爾撒納的叛亂，徹底將準(zhǔn)噶爾部平定。不久新疆又爆發(fā)大小和卓的叛亂，清朝為鞏固在新疆的統(tǒng)治，設(shè)立伊犁將軍、塔爾巴哈臺(tái)領(lǐng)隊(duì)大臣等職務(wù)，將新疆正式納入中央朝廷的直轄統(tǒng)治之下！